Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms