Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSPL2Q05D32 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms