Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LINC02243-201ENST00000441841 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TNP2Q05952 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms