Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN12Q05209 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms