Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A3Q01959 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms