Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms