Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms