Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms