Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms