Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EEFSECP57772 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms