Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE2P56282 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLE2P56282 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLE2P56282 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLE2P56282 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLE2P56282 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLE2P56282 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLE2P56282 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE2P56282 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE2P56282 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms