Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATN1P54259 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATN1P54259 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATN1P54259 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATN1P54259 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATN1P54259 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATN1P54259 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATN1P54259 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATN1P54259 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATN1P54259 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATN1P54259 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATN1P54259 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms