Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCA2P51587 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms