Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP4P49662 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP4P49662 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP4P49662 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms