Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP3P42574 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP3P42574 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms