Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBX2P40425 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBX2P40425 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PBX2P40425 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms