Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGCXP38435 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms