Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms