Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD38P28907 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD38P28907 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD38P28907 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD38P28907 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD38P28907 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms