Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSFA2P28290 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms