Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNMT1P26358 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms