Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KDELR1P24390 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms