Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms