Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF3P18847 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF3P18847 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF3P18847 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms