Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSPP15924 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms