Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMP1P11279 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms