Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms