Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEFLP07196 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFLP07196 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFLP07196 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFLP07196 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFLP07196 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFLP07196 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFLP07196 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFLP07196 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFLP07196 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFLP07196 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms