Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APODP05090 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APODP05090 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APODP05090 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms