Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX7O95931 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX7O95931 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms