Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRATO95237 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRATO95237 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRATO95237 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms