Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPHP4O75161 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms