Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB3O43889 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB3O43889 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB3O43889 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB3O43889 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB3O43889 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB3O43889 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREB3O43889 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms