Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EDIL3O43854 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms