Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF14O43557 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms