Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBDO15205 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBDO15205 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms