Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
J3QRK9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
J3QRK9 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3QRK9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms