Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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