Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms