Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms