Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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