Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms