Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP1Q9Y3L3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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SH3BP1Q9Y3L3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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SH3BP1Q9Y3L3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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SH3BP1Q9Y3L3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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SH3BP1Q9Y3L3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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SH3BP1Q9Y3L3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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