Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms