Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PADI1Q9ULC6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms