Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms