Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH3Q9UHC1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH3Q9UHC1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms