Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms