Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms