Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNIH4Q9P003 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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